PCR numérique (dPCR)

En tant que fournisseur expert de services de dPCR, notre équipe prend en charge toute application fondée sur la dPCR en utilisant des tests prêts à l’emploi ou nécessitant la conception d’amorce sur mesure, et ce, dans un laboratoire agréé ISO 17025. Nous utilisons la technologie de PCR numérique en gouttelettes QX200™ mise au point par l’entreprise Bio‑Rad avec laquelle nous avons développé une étroite collaboration.

La dPCR permet la quantification des acides nucléiques avec une exactitude, une précision et une sensibilité relative supérieures. Cette technologie est très performante dans les applications suivantes :

• Quantification de gènes peu abondants ou de petites différences
• Quantification absolue
• Analyse de la variation du nombre de copies (CNV)
• Détermination du nombre de copies de vecteurs (VCN) et détection de rétrovirus ou de lentivirus réplicatifs, dans un contexte de thérapie cellulaire adoptive
• Détection d’événements rares, comme la mutation de gènes liée au cancer à partir de tissus ou de biopsies liquides

Puisque des concentrations absolues sont déterminées, les données peuvent être facilement interprétées et comparées entre les différents échantillons ou les différentes expériences, notamment dans un contexte clinique.

La PCR numérique permet une quantification absolue ne nécessitant pas l’utilisation de courbes étalons, contrairement à la PCR quantitative. La PCR numérique est particulièrement performante pour quantifier les cibles de faible abondance ou les petites différences.

Apprenez-en plus sur le potentiel intrinsèque de nos tests de PCR numérique en gouttelettes (ddPCR) adaptés aux études cliniques avec ces 4 exemples d’applications réalisées par notre équipe :

• Analyse de variants rares dans l’ADN acellulaire (cfDNA)
• Quantification de petites modifications de l’épissage alternatif
• Quantification absolue de la biodistribution de lymphocytes T exprimant des récepteurs antigéniques chimériques (CAR T)
• Quantification absolue des vecteurs utilisés pour la thérapie cellulaire CAR T dans le cadre d’essais cliniques

Notre équipe contribue à l’établissement de normes dans le domaine de la PCR numérique en participant à l’élaboration de lignes directrices et à la publication d’articles scientifiques clés :

• The Digital MIQE Guidelines Update: Minimum Information for Publication of Quantitative Digital PCR Experiments for 2020 (Huggett JF, et al. Clin Chem, 2020)
• Quality control of digital PCR assays and platforms (Vynck M, et al. Anal Bioanal Chem, 2017)
• Flexible analysis of digital PCR experiments using generalized linear mixed models (Vynck M, et al. Biomol Detect Quantif, 2016)