Services de séquençage de l'ARN (RNAseq) pour le profilage de l'expression génique, l'analyse transcriptomique, la découverte de biomarqueurs et la recherche en médecine de précision.
Utilisez le séquençage de l'ARN (RNAseq) pour identifier les gènes différentiellement exprimés, les voies de signalisation, les fusions et les signatures immunitaires en un seul flux de travail.
Avec un accès aux principales plateformes de séquençage de nouvelle génération (NGS) et de biologie spatiale, les services complets de CellCarta comprennent la préparation d'échantillons et l'analyse multimodale.
Validés dans un environnement accrédité BPCL et CAP/CLIA, nos services de séquençage de l'ARN peuvent être facilement mis en œuvre pour la découverte de biomarqueurs et les essais cliniques.
Nos flux de travail RNAseq sont conçus pour répondre aux besoins de votre étude. Notre offre couvre l'ensemble du processus, y compris l'extraction d'ARN, la préparation de banques, le séquençage et le rapport final.
Nos flux de travail utilisent les dernières technologies pour un RNAseq de qualité et à haut débit, notamment NovaSeq X Plus, NovaSeq 6000, NextSeq 550Dx.
Nos services de séquençage de l'ARN sont validés pour une utilisation avec un large éventail de types d'échantillons cliniques, y compris les tissus frais ou fixés, le sang total et les biofluides.
CellCarta a validé plusieurs tests RNAseq OTS pour une mise en œuvre clinique, notamment :
Alternativement, nous pouvons développer et valider un panel d'expression génique et un test sur mesure pour tout gène ou ensemble de gènes, offrant une couverture pour un large éventail de voies biologiques et d'états pathologiques.
Notre équipe experte en BioIT peut soutenir votre étude grâce à une analyse standard des données RNAseq en vrac, notamment :
De plus, notre pipeline d'analyse avancée peut effectuer l'appel de variants, la déconvolution immunitaire, le typage HLA, et calcule la charge mutationnelle tumorale exprimée (eTMB) et l'IMS à partir d'un seul jeu de données RNAseq en vrac.
Nos flux de travail RNAseq sont conçus pour répondre aux besoins de votre étude. Notre offre couvre l'ensemble du processus, y compris l'extraction d'ARN, la préparation de banques, le séquençage et le rapport final.
Nos flux de travail utilisent les dernières technologies pour un RNAseq de qualité et à haut débit, notamment NovaSeq X Plus, NovaSeq 6000, NextSeq 550Dx.
Nos services de séquençage de l'ARN sont validés pour une utilisation avec un large éventail de types d'échantillons cliniques, y compris les tissus frais ou fixés, le sang total et les biofluides.
CellCarta a validé plusieurs tests RNAseq OTS pour une mise en œuvre clinique, notamment :
Alternativement, nous pouvons développer et valider un panel d'expression génique et un test sur mesure pour tout gène ou ensemble de gènes, offrant une couverture pour un large éventail de voies biologiques et d'états pathologiques.
Notre équipe experte en BioIT peut soutenir votre étude grâce à une analyse standard des données RNAseq en vrac, notamment :
De plus, notre pipeline d'analyse avancée peut effectuer l'appel de variants, la déconvolution immunitaire, le typage HLA, et calcule la charge mutationnelle tumorale exprimée (eTMB) et l'IMS à partir d'un seul jeu de données RNAseq en vrac.
CellCarta a collaboré avec Watchmaker pour valider la préparation de banques d'ARN avec Polaris Depletion pour le séquençage du transcriptome entier dans des types d'échantillons complexes. Ce flux de travail s'avère être une alternative adaptée aux flux de travail RNAseq basés sur la capture d'exome, avec plusieurs applications cliniques possibles.
Permettez une analyse transcriptomique à grande échelle de cellules individuelles en intégrant les services de séquençage unicellulaire de CellCarta à votre recherche. Le séquençage unicellulaire révèle des informations approfondies à partir d'échantillons biologiques complexes, ce qui en fait un outil puissant pour le développement thérapeutique.
CellCarta a développé le modèle Bio-IT RNA-Seq qui extrait des informations sur l'eTMB, l'IMS, les lymphocytes infiltrant la tumeur (TIL) et les signatures géniques immunitaires en utilisant uniquement des données RNAseq. Ce modèle prédit avec précision la réponse des patients à la thérapie par inhibition des points de contrôle immunitaires sans recourir à une approche multiomique.
Des services de séquençage de l'ARN fiables offrant précision, exactitude et sensibilité.
Technologie de pointe
Pipeline de bioanalyse intégré
Exécution mondiale
Flux de travail personnalisés
Solutions évolutives
Quantification des acides nucléiques avec une précision, une exactitude et une sensibilité supérieures.
Soutien pour les applications qPCR à l'aide de tests prêts à l'emploi ou d'amorces personnalisées et validées.
Analyse précise et à haut débit du matériel génétique, alliant rapidité et évolutivité.
Les services de séquençage de l'ARN de CellCarta couvrent l'ensemble du spectre expérimental : extraction d'ARN, préparation de banques, séquençage, analyse bio-informatique et rapport.
Le séquençage est effectué sur des plateformes NGS de premier plan, notamment NovaSeq X Plus, NovaSeq 6000 et NextSeq 550Dx. Des plateformes complémentaires telles que NanoString nCounter et GeoMx Digital Spatial Profiler élargissent l'offre à la biologie spatiale. Chaque projet est soutenu par une analyse de données experte et un rapport structuré.
Oui. CellCarta a développé un flux de travail pour prédire la réponse à l'inhibition des points de contrôle immunitaires en utilisant uniquement des données RNA-seq.
Les profils d'ARN tumoral peuvent être utilisés pour évaluer la charge mutationnelle tumorale exprimée (eTMB), l'instabilité microsatellitaire (IMS), les lymphocytes infiltrant la tumeur (TIL) et les signatures géniques immunitaires — fournissant des informations exploitables sur les biomarqueurs sans recourir à une approche multiomique intensive. En savoir plus ici.
CellCarta accepte une grande variété de types d'échantillons, y compris les tissus frais, les tissus frais congelés, les tissus fixés, les fluides corporels, le sang total et les cellules isolées. La déplétion des molécules d'ARN indésirables à partir de l'ARN total est également proposée, favorisant un signal plus net à partir d'échantillons complexes ou à faible quantité.
Les analyses standards comprennent la quantification des gènes et des transcrits, la détection de gènes de fusion, l'expression génique différentielle et l'analyse d'enrichissement d'ensembles de gènes (GSEA). Les flux de travail avancés s'étendent à l'appel de variants, à la charge mutationnelle tumorale exprimée (eTMB), à la détection de l'instabilité microsatellitaire (IMS), à la déconvolution immunitaire et au typage HLA. Cela permet une caractérisation moléculaire approfondie à partir d'un seul jeu de données RNA-seq.
Oui. Le séquençage de l'ARN unicellulaire est disponible via la plateforme 10x Genomics Chromium, permettant un profilage transcriptomique à haute résolution au niveau de la cellule individuelle.
Pour le contexte spatial, CellCarta propose la transcriptomique spatiale via 10x Genomics Visium et NanoString GeoMx Digital Spatial Profiler (DSP), superposant les données d'expression génique à l'architecture tissulaire. En savoir plus sur nos services de séquençage de l'ARN unicellulaire ici.
Les clients reçoivent les données de séquençage brutes, les indicateurs de contrôle qualité, des rapports d'analyse annotés, ainsi qu'un accès à la visualisation interactive des données via CellEngine. Les livrables sont structurés pour soutenir la prise de décision scientifique en aval, les soumissions réglementaires et les rapports prêts pour publication.
