Rapide, simple, évolutif. Découvrez la nouvelle génération de cytométrie en flux avec CellEngine, votre solution basée sur le cloud et prête pour l'IA, pour une analyse complète.
Notre logiciel basé sur le cloud offre une analyse simple et complète de bout en bout au sein d'une seule plateforme, avec des rapports personnalisables et des visualisations flexibles pilotées par métadonnées.
CellEngine est conçu pour traiter des millions de cellules, des dizaines de paramètres et des milliers d'échantillons, ce qui en fait la solution idéale pour l'analyse de la maladie résiduelle minimale (MRD), les criblages de composés, les essais cliniques et les études à l'échelle populationnelle réalisées sur des instruments de pointe. Sa conformité GxP et sa sécurité de niveau entreprise en font le logiciel de cytométrie en flux de référence.
CellEngine comprend une suite d'algorithmes de réduction de dimensionnalité et de clustering, notamment UMAP, FlowSOM et Phenograph. Les versions optimisées de CellEngine peuvent analyser des dizaines à des centaines de millions de cellules en quelques minutes, et non en quelques heures. Les résultats peuvent ensuite être visualisés et interrogés sans quitter CellEngine.
L'outil d'autogating de CellEngine utilise l'apprentissage automatique (ML) pour ajuster automatiquement les positions des portes selon votre hiérarchie. CellEngine apprend vos décisions de placement à partir d'un petit ensemble de fichiers gatés manuellement et les applique de manière transparente à vos fichiers restants en quelques secondes.
Contrairement aux autres logiciels de cytométrie en flux, CellEngine ne nécessite aucune étape d'entraînement ni développement de pipeline, et, si nécessaire, vous pouvez ajuster manuellement les portes par la suite.
Commencez par ajouter des métadonnées d'échantillon, telles que le point temporel, le donneur, le dosage et le traitement, à l'aide d'une interface de type feuille de calcul familière. Ces métadonnées peuvent ensuite être utilisées pour gater systématiquement vos données, organiser automatiquement vos visualisations ou filtrer votre jeu de données pour n'en retenir qu'un sous-ensemble d'intérêt.
Cette approche automatisée réduit les erreurs humaines et permet de gagner du temps par rapport à l'organisation et à la production de rapports manuelles des données.
Intégrez CellEngine de manière transparente à vos systèmes LIMS, ELN et pipelines d'automatisation afin de simplifier la gestion des données.
Notre API complète vous permet de repousser les limites de l'analyse selon votre imagination. Intégrez vos recherches dans des modèles d'IA personnalisés ou utilisez-la directement dans des notebooks Jupyter pour mener des analyses bioinformatiques reproductibles.
Les formats d'importation/exportation standards, y compris Gating-ML, rendent CellEngine interopérable avec l'écosystème scientifique.
La sûreté et la sécurité sont au cœur de CellEngine. Nous protégeons vos données grâce à des mesures de sécurité de niveau entreprise, en profondeur, validées par la certification ISO 27001 obtenue à l'échelle de l'ensemble de l'entreprise CellCarta. Soutenue par notre engagement de disponibilité (SLA), votre recherche reste sécurisée, confidentielle et toujours accessible lorsque vous en avez besoin.
CellEngine comprend une suite d'algorithmes de réduction de dimensionnalité et de clustering, notamment UMAP, FlowSOM et Phenograph. Les versions optimisées de CellEngine peuvent analyser des dizaines à des centaines de millions de cellules en quelques minutes, et non en quelques heures. Les résultats peuvent ensuite être visualisés et interrogés sans quitter CellEngine.
L'outil d'autogating de CellEngine utilise l'apprentissage automatique (ML) pour ajuster automatiquement les positions des portes selon votre hiérarchie. CellEngine apprend vos décisions de placement à partir d'un petit ensemble de fichiers gatés manuellement et les applique de manière transparente à vos fichiers restants en quelques secondes.
Contrairement aux autres logiciels de cytométrie en flux, CellEngine ne nécessite aucune étape d'entraînement ni développement de pipeline, et, si nécessaire, vous pouvez ajuster manuellement les portes par la suite.
Commencez par ajouter des métadonnées d'échantillon, telles que le point temporel, le donneur, le dosage et le traitement, à l'aide d'une interface de type feuille de calcul familière. Ces métadonnées peuvent ensuite être utilisées pour gater systématiquement vos données, organiser automatiquement vos visualisations ou filtrer votre jeu de données pour n'en retenir qu'un sous-ensemble d'intérêt.
Cette approche automatisée réduit les erreurs humaines et permet de gagner du temps par rapport à l'organisation et à la production de rapports manuelles des données.
Intégrez CellEngine de manière transparente à vos systèmes LIMS, ELN et pipelines d'automatisation afin de simplifier la gestion des données.
Notre API complète vous permet de repousser les limites de l'analyse selon votre imagination. Intégrez vos recherches dans des modèles d'IA personnalisés ou utilisez-la directement dans des notebooks Jupyter pour mener des analyses bioinformatiques reproductibles.
Les formats d'importation/exportation standards, y compris Gating-ML, rendent CellEngine interopérable avec l'écosystème scientifique.
La sûreté et la sécurité sont au cœur de CellEngine. Nous protégeons vos données grâce à des mesures de sécurité de niveau entreprise, en profondeur, validées par la certification ISO 27001 obtenue à l'échelle de l'ensemble de l'entreprise CellCarta. Soutenue par notre engagement de disponibilité (SLA), votre recherche reste sécurisée, confidentielle et toujours accessible lorsque vous en avez besoin.
CellEngine couvre l'ensemble des visualisations, notamment les graphiques, les cartes de chaleur, les graphiques de flux et les courbes dose-réponse. Les tableaux croisés dynamiques pilotés par métadonnées de ces visuels facilitent grandement les vues au niveau de l'étude. Les illustrations générées par lots alimentent des rapports qui peuvent se mettre à jour automatiquement au fil de l'avancement de votre étude.
CellEngine propose les fonctionnalités requises pour une utilisation dans des environnements conformes à la norme 21 CFR 11 et à l'annexe 11 de l'UE.
CellCarta valide CellEngine à l'aide de milliers de tests automatisés afin de garantir des performances cohérentes. Nous proposons également des dossiers de documentation et une validation personnalisée de vos propres flux de travail d'analyse.
Le partenariat de CellCarta avec Standard BioTools apporte un prétraitement rapide et automatisé à la cytométrie de masse. L'outil de nettoyage CyTOF fonctionne avec tout fichier FCS CyTOF pour identifier les cellules vivantes et uniques et générer un rapport de contrôle qualité en quelques secondes, vous permettant de vous concentrer sur les résultats qui comptent.
CellEngine est spécialement conçu pour l'analyse de cytométrie en flux hautement complexe.
Rapide et évolutif
Conforme à la réglementation
Sûr et sécurisé
Prêt pour l'IA
Analyses approfondies
Un logiciel de cytométrie en flux polyvalent pour de multiples usages.
Obtenez une vue d'ensemble de tout votre essai, couvrant chaque point temporel pour chaque donneur.
Générez des courbes dose-réponse pour des dosages à haut débit, basés sur plaques.
Des graphiques Levey-Jennings interactifs permettent de suivre les performances jusqu'aux données unicellulaires sous-jacentes.
CellEngine est utilisé par des chercheurs universitaires, des entreprises de biotechnologie de petite et moyenne taille, ainsi que par de grandes sociétés biopharmaceutiques à travers le monde. CellEngine alimente également l'analyse de l'ensemble des services experts de cytométrie en flux de CellCarta, y compris les études exploratoires et les essais cliniques de phase 1 à phase 3.
Une liste de certaines publications ayant utilisé CellEngine, comprenant de nombreux rapports d'essais de phase 1 et phase 2, est disponible sur notre page Publications.
L'ajustement automatique des portes de CellEngine a été conçu en étroite collaboration avec nos cytométristes afin de répondre aux nombreuses lacunes des solutions existantes :
Consultez une étude de cas ici.
Si vous disposez d'analyses existantes réalisées avec d'autres logiciels de cytométrie en flux, CellEngine peut importer des données depuis :
Contactez-nous pour en savoir plus sur les options de migration depuis d'autres logiciels.
CellEngine dispose d'algorithmes de réduction de dimensionnalité, notamment PCA, t-SNE et UMAP, ainsi que d'algorithmes de clustering, notamment FlowSOM, Phenograph et le clustering d'ensemble de graphes (ECG).
Les implémentations de ces algorithmes par CellEngine offrent souvent une fonctionnalité et une facilité d'utilisation améliorées par rapport aux publications originales. Par exemple, le t-SNE de CellEngine utilise une initialisation par PCA plutôt qu'une initialisation aléatoire, offrant des résultats plus rigoureux statistiquement et plus cohérents entre les exécutions ; et le Phenograph de CellEngine prend en charge la méthode Leiden, qui constitue une amélioration par rapport à la méthode Louvain originale.
Nous avons également largement optimisé les algorithmes en matière de performance, réduisant le temps d'exécution à une fraction de celui de la plupart des autres logiciels de cytométrie en flux : l'UMAP de CellEngine peut analyser 10 millions de cellules en environ 20 minutes, le Leiden de CellEngine peut analyser 10 millions de cellules en environ 15 minutes, et le FlowSOM de CellEngine peut analyser 400 millions de cellules en seulement quelques minutes.
De plus amples informations sur les algorithmes de CellEngine sont disponibles dans la documentation.
